Eind 2007 is AFAS gestart met het certificeringstraject rondom haar dienstverlening voor In-Service salarisverwerking. Binnen een aantal maanden is het resultaat daar: het Servicebureau van AFAS heeft het felbegeerde SAS 70, type 2 certificaat behaald.
De certificering houdt in dat AFAS bedrijven ondersteunt die moeten voldoen aan de Sarbanes-Oxley Act (SOX) wetgeving. AFAS geeft haar klanten hiermee een keurmerk van totale dienstverlening, kwaliteit en betrouwbaarheid. AFAS heeft ontzettend veel energie gestoken om het proces rondom haar In-Service salarisverwerking te verbeteren en maximaal te automatiseren. Dit is de basis geweest voor een goede certificering. De toetsing van de kwaliteit en de gemaakte afspraken is verzorgd door Ernst & Young, EDP Audit die het certificaat afgeeft. Tussentijds zijn er veel steekproeven gedaan om te zien of de herziene processen en automatisering logisch en uitvoerbaar bleken. Ook zijn de medewerkers van het Servicebureau regelmatig onderworpen aan toetsingen.
Naast de certificering van de salarisverwerking heeft AFAS besloten, in haar verdergaande optimalisering en digitalisering, het versturen van kopie-loonstroken per 1 januari 2008 volledig te laten vervallen. Belangrijkste onderbouwing is dat de klant te allen tijde de loonstrook in het digitale dossier kan opvragen en reproduceren.