In 2016 stapten vijf ziekenhuizen over naar de geïntegreerde oplossing van AFAS. Naast Erasmus MC, het grootste academisch ziekenhuis van Nederland, kozen ook Amphia en de Sint Maartenskliniek voor de HRM/Payroll software. Het Rode Kruis Ziekenhuis en BovenIJ tekenden voor de ERP-oplossing van AFAS. Vergeleken met 2015 nam de omzet in de Zorg en Welzijn-sector toe met 72 procent. Deze sterke omzetgroei komt enerzijds voort uit een groot aantal nieuwe klanten en anderzijds uit de uitbreiding van de dienstverlening bij bestaande klanten.
De keuze voor één standaard softwarepakket wordt ook in de zorg steeds vaker gezien als de meest geschikte oplossing om efficiënter te werken tegen substantieel lagere kosten. Steeds meer zorginstellingen kiezen naast HRM/Payroll ook voor andere onderdelen van het productaanbod van AFAS. Zo breidde een aantal zorginstellingen haar AFAS-pakket uit met software ter ondersteuning van de financiële administratie, inkoopprocessen en CRM. Met de best practices op het gebied van ERP-bedrijfsvoering zijn klanten in staat veel applicaties uit te faseren en de processen te automatiseren met de software van AFAS.